El Archivo de Arantzazu se trata de un archivo histórico-administrativo donde se aloja una variedad de fondos diferentes, entre ellos cabe destacar el Archivo de música antigua y moderna, sin duda, el Archivo del Colegio, la Casa de Ejercicios y la Colección de Sermones manuscritos. A parte de ello, se conservan los fondos personales de franciscanos, tales como Villasante, Gandiaga, Lasa, Omaetxeberria… entre otros.
Por último, cabe destacar el nuevo fondo de ABAS - Archivo de la Basílica, comprendido entre los años 1939-1969, y el nuevo Fondo de Urbia.
Archivos de otros conventos franciscanos
Se conservan, además, los archivos procedentes de otros conventos franciscanos pertenecientes a la Provincia de Arantzazu:
Nuevos fondos en catalogación
Actualmente se está trabajando en la catalogación de nuevos fondos:
